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Bioproduire grâce aux bactéries
Créée dans le cadre du programme Atige de Genopole, l’équipe d’Andrew Tolonen a développé un ensemble d’outils biotechnologiques pour la transformation génétique et le contrôle de l’expression des gènes chez les bactéries du genre Clostridium. Ces travaux ouvrent la voie à des applications de production par voie biologique. Les Clostridies, capables de fermenter la biomasse végétale, notamment les fibres lignocellulosiques présentes dans les débris végétaux, pourraient ainsi produire des molécules à haute valeur ajoutée comme des médicaments ou autres composés d’intérêt. Installée dans l’Unité de Génomique métabolique1 du laboratoire Genoscope, l’équipe a développé une approche méthodique pour optimiser l’ingénierie génétique de Clostridium phytofermentans, utilisée comme espèce modèle pour une application plus large au genre Clostridium. Le groupe de scientifiques a tout d’abord optimisé la transformation génétique de la bactérie, puis recherché les moyens de moduler l’expression des gènes d’intérêt apportés.
1 (CEA/CNRS/Université d’Évry Paris-Saclay)

Séminaire CEA-Genoscope animé par Murat Eren
Le 27 mars 2023, le Genoscope a organisé un séminaire sur le thème de la « Génétique des populations microbiennes tenant compte de la structure » (ou en anglais Structure informed microbial population genetics). Cet événement était animé par Murat Eren, responsable de l’équipe Ecosystem Data Science, au Helmholtz Institute for Functional Marine Biodiversity à l’Université d’Oldenburg en Allemagne. Sa présentation a porté sur une étude décrivant une approche visant à intégrer la microbiologie environnementale aux progrès récents dans la prédiction de la structure des protéines. Elle illustre l’association étroite entre les variantes génétiques intra-populations, les pressions sélectives environnementales et les propriétés structurelles des protéines.
Séminaire CEA-Genoscope :
la diversité chimique des substances naturelles
Le 24 novembre 2023, le Genoscope a invité les professeurs Erwan Poupon et Mehdi Beniddir lors d’un séminaire. L’objectif : mettre en avant les outils et les approches d’exploration de la diversité des substances naturelles et leurs voies de biosynthèse ainsi que l’émergence de la complexité moléculaire, la métabolomique.
Genoscope participe à la découverte des mirusvirus
Les analyses métagénomiques du Genoscope ont permis, au printemps 2023, de caractériser l’ADN d’un nouveau groupe de virus abondants à la surface des mers et des océans, où ils infectent du plancton unicellulaire. Les gènes de ces mirusvirus sont à mi-chemin entre ceux des virus de l’herpès, présents chez l’homme et les animaux, et ceux des virus géants récemment identifiés. Cette découverte offre ainsi à la communauté scientifique de nouvelles opportunités pour étudier l’écologie et l’évolution des virus à ADN, dans les océans et au-delà.
