La plateforme MicroScope célèbre ses 20 ans d’annotation et d’analyse comparative des génomes microbiens. Pour marquer cet anniversaire le 26 septembre 2023, MicroScope a réuni sa communauté d’utilisateurs à Genopole. Six intervenants ont partagé leurs expériences, tandis que l’équipe du LABGeM a présenté les derniers développements en pangénomique.
Depuis sa création en 2001 par Claudine Médigue au Genoscope, grâce au dispositif Atige de Genopole, MicroScope a évolué pour devenir un outil essentiel pour les microbiologistes. D’abord nommée MaGe, la plateforme a été rebaptisée MicroScope en 2007. Elle intègre et analyse les génomes et métagénomes, et fournit des services pour les études d’expression des gènes et la recherche de variants.
Avec plus de 6 700 utilisateurs, dont 65 % à l’international, MicroScope a contribué à l’analyse de plus de 25 000 génomes microbiens. En 2023, soutenue par Genopole et l’appel à projets SATURNE, elle a augmenté ses capacités de stockage de données de plus de 30 %.
